58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  100 
 
 		 222 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  50.75 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  41.21 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  44.32 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  39.11 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  38.34 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  54.32 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  31.71 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  37.11 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  25.14 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  25.13 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  27.89 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2359  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  36.64 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  29.28 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  36.55 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3570  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4223  normal  0.0816672 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10238  acetyltransferase, GNAT family family (AFU_orthologue; AFUA_4G09540)  29.58 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  22.28 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48184  predicted protein  38.6 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3461  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.231377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  31.05 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  hitchhiker  0.00358603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  29.12 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  21.88 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  20.97 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1800  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313237  hitchhiker  0.00103766 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7224  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0475463  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1607  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.991073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0865  hypothetical protein  24.86 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  22.49 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0524731  hitchhiker  0.000628813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 		 148 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>