38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4434 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  396  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  31.44 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  26.18 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  26.18 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  26.67 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  48.53 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  43.66 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  28.72 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  23.08 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  21.79 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0524731  hitchhiker  0.000628813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  35.43 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  25.67 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  32 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.12 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  23.26 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  21.39 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  26.2 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  40.26 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  22.62 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  24.85 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  24.55 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  25.47 
 
 		 214 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.687437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.41 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  25.81 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>