38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2887 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  42.69 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
202 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  38.66 
 
 
201 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  39.11 
 
 
222 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  49.37 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  36.94 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  34.57 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  39.01 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  31.71 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  39.8 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  43.37 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  41.49 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3570  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4223  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
203 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  47.46 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2359  GCN5-related N-acetyltransferase  28.72 
 
 
192 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  29.12 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 
228 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.687437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
196 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  24.4 
 
 
215 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  25.15 
 
 
200 aa  45.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58555  predicted protein  37.5 
 
 
267 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  26.2 
 
 
194 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>