31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3055 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
208 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
200 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  30.88 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  32.66 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  31.91 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  26.6 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
208 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  31.46 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
197 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.86 
 
 
220 aa  58.2  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  29.7 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
86 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  28.72 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.77 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  20.1 
 
 
202 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  23.66 
 
 
215 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 
156 aa  45.1  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2490  hypothetical protein  34.67 
 
 
220 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000942107  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08373  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 
296 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.276686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>