30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0713 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  76.81 
 
 
228 aa  325  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.687437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0919  hypothetical protein  59.38 
 
 
128 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.685206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  26.7 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
208 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  27.46 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  23.47 
 
 
209 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
218 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1886  acetyltransferase  22.34 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  24.72 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5140  GCN5-related N-acetyltransferase  42.19 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
86 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  37.04 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.73 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  28.25 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  24.87 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  18.32 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  22.96 
 
 
209 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48184  predicted protein  29.52 
 
 
303 aa  42.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.56 
 
 
163 aa  41.6  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>