39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0677 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  100 
 
 		 202 aa  424  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  25.67 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  20.3 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  19.29 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  21.29 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  19.29 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  21.79 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  23.83 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  20.97 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  21.28 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  20.53 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  21.9 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  20 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  26.13 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  23.23 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.687437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  20.43 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  20 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  22.07 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  22.75 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  20.1 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  19.02 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5497  GCN5-related N-acetyltransferase  25.55 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000151492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 86 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  23.17 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  18.28 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  24.76 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24990  acetyltransferase  34.48 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  24.62 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0616  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.120941  normal  0.314865 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  25.69 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  24.69 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>