61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2400 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  85 
 
 
200 aa  290  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
200 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  49.43 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  36.27 
 
 
203 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  52.5 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  49.37 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  48.19 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  48.1 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  43.04 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0865  hypothetical protein  26.04 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0974  puromycin N-acetyltransferase,-like protein  26.87 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  39.8 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_847  acetyltransferase  25 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  38.8 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  23.76 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.55 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  33 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  33.78 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  30.77 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  24.44 
 
 
192 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0524731  hitchhiker  0.000628813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
203 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  37.66 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  23.68 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2359  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  25.13 
 
 
208 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
165 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3310  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10238  acetyltransferase, GNAT family family (AFU_orthologue; AFUA_4G09540)  34.62 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.28295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3456  acetyltransferase  30.3 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.436369  hitchhiker  6.246790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  34.12 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09493  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.163645  normal  0.596121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
141 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13520  Acetyltransferase  30.88 
 
 
185 aa  42  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00036036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  32.86 
 
 
230 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1890  acetyltransferase  28.79 
 
 
207 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  42  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5716  hypothetical protein  35.09 
 
 
75 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2809  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
144 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
197 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  24.69 
 
 
202 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>