75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5244 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 186 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  36.93 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  45.26 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  53.66 
 
 		 86 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  31.18 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  32.34 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  45.45 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2359  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  29.11 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  35.9 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  48.53 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  39.78 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  hitchhiker  0.00358603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0865  hypothetical protein  35.53 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_847  acetyltransferase  35.53 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  25 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  28.87 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_002936  DET0974  puromycin N-acetyltransferase,-like protein  31.65 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  37.84 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  52.46 
 
 		 230 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.62 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  37.14 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  33.8 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  36.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  37.84 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  24.46 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  26.88 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58555  predicted protein  25.25 
 
 		 267 aa  48.5  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  25.93 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48184  predicted protein  35.94 
 
 		 303 aa  46.2  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0189  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  33.33 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5716  hypothetical protein  35.85 
 
 		 75 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.687437  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0773  hypothetical protein  34.69 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208077  normal  0.373974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6547  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.45 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09493  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.163645  normal  0.596121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3310  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1746  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 147 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>