43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3007 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
156 aa  327  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
202 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  39.13 
 
 
215 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  31.48 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
197 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
195 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
208 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  29.73 
 
 
212 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  38.6 
 
 
200 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
218 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  36 
 
 
220 aa  51.2  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  40 
 
 
222 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.687437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
227 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  36.36 
 
 
203 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  33.94 
 
 
230 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00454604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  26.02 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
211 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3461  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
233 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.231377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  24.76 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  22.79 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  27.03 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  25.36 
 
 
215 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  29.29 
 
 
237 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  21.02 
 
 
209 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48184  predicted protein  25.74 
 
 
303 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  32.98 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03344  hypothetical acetyltransferase (Eurofung)  34.57 
 
 
249 aa  41.2  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0578992  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
207 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>