41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2359 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2359  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  33.16 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8961  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  29.61 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
197 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  34.2 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  30.96 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  30.96 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  hitchhiker  0.00358603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.98 
 
 
222 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
86 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  29.02 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  26.46 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  28.95 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.65 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  28.72 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4868  hypothetical protein  39.19 
 
 
171 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2856  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  36.21 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2490  hypothetical protein  37.04 
 
 
220 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000942107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 
192 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0524731  hitchhiker  0.000628813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
207 aa  42  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  27.87 
 
 
212 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4537  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
166 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.69779 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7224  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
161 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0475463  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5211  putative acetyltransferase  40 
 
 
255 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>