97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1179 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1179  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  343  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7783  acetyltransferase, GNAT family  35.03 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747821  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1121  acetyltransferase, GNAT family  33.61 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.411224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4069  hypothetical protein  46 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0539  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2941  acetyltransferase, GNAT family  34.35 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4157  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  45.19 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0175949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1575  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
209 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
206 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1090  hypothetical protein  38.83 
 
 
197 aa  61.6  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.914734  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3936  acetyltransferase  29.87 
 
 
207 aa  61.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2094  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404304  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1590  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4701  hypothetical protein  32.54 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1514  GCN5-related N-acetyltransferase  40.78 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0323  hypothetical protein  29.65 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2524  GCN5-related N-acetyltransferase  31.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0306  hypothetical protein  29.65 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0622  hypothetical protein  35.29 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  43.18 
 
 
268 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2452  acetyltransferase  31.2 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.765579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3558  GCN5-related N-acetyltransferase  37.38 
 
 
200 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.120695  normal  0.566625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
236 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
196 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00492608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1744  GCN5-related N-acetyltransferase  35.24 
 
 
201 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  39.81 
 
 
240 aa  51.2  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0955169  normal  0.362531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2881  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 
200 aa  50.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
202 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351729  normal  0.46007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2638  acetyltransferase, putative  30.71 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.77086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776348  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0839  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0880466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2042  acetyltransferase  28.57 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
207 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3264  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3059  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3181  hypothetical protein  27.27 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0859  hypothetical protein  34.62 
 
 
198 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.5826  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4944  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
198 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2385  acetyltransferase, GNAT family  36.25 
 
 
203 aa  47.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
203 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.66399  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755062  normal  0.374224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3130  acetyltransferase, GNAT family  28.81 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1904  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3187  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
197 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2850  acetyltransferase  31.79 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2139  acetyltransferase, GNAT family  24.36 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3111  acetyltransferase, GNAT family  23.72 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1220  hypothetical protein  28.07 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4468  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
198 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282093  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248347  normal  0.0288305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1214  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00447272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3108  acetyltransferase  23.72 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2859  acetyltransferase  23.72 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0157116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2891  acetyltransferase  23.72 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0153318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
199 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1594  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3097  acetyltransferase, GNAT family  23.72 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1614  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1811  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4143  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2204  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
199 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1258  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
206 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112856  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0205  GNAT family acetyltransferase  32.69 
 
 
197 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1465  acetyltransferase  32.38 
 
 
206 aa  44.7  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2118  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
197 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.109403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2743  GCN5-related N-acetyltransferase  34.45 
 
 
199 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1120  acetyltransferase, putative  33.93 
 
 
185 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.262242  normal  0.137241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
200 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.598769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2820  acetyltransferase  23.08 
 
 
195 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1092  putative amino-acid acetyltransferase  28.35 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.981692  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6315  GCN5-related N-acetyltransferase  37 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1041  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938942  normal  0.5061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3485  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143784  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5405  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3356  putative acetyltransferase  39.77 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0435273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1161  putative acetyltransferase  29.37 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1022  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2475  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1895  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0997  hypothetical protein  30.43 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121835  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5474  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
190 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6273  putative N-acetyltransferase (GCN5-related)  27.45 
 
 
197 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 
197 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.427445  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3129  acetyltransferase  22.44 
 
 
195 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.203794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
196 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>