More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2042 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2042  acetyltransferase  100 
 
 
198 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0496  ribosomal protein N-acetylase-like protein  42.27 
 
 
197 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.263898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
206 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02250  acetyltransferase, GNAT family protein  35.36 
 
 
197 aa  121  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1041  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938942  normal  0.5061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5802  acetyltransferase, GNAT family  34.25 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.481451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3936  acetyltransferase  30.98 
 
 
207 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0839  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0880466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3085  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
204 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5405  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
199 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3130  acetyltransferase, GNAT family  26.22 
 
 
195 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157226  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5371  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
198 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.612286  normal  0.40769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3097  acetyltransferase, GNAT family  27.75 
 
 
195 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2820  acetyltransferase  26.22 
 
 
195 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
215 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3485  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
215 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3111  acetyltransferase, GNAT family  25.61 
 
 
195 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1154  hypothetical protein  30.48 
 
 
201 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2859  acetyltransferase  25.61 
 
 
195 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0157116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1590  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
200 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2094  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
152 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404304  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
199 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1214  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
207 aa  104  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00447272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2891  acetyltransferase  25.61 
 
 
195 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0153318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3108  acetyltransferase  25.61 
 
 
195 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
199 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248347  normal  0.0288305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
197 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.427445  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2139  acetyltransferase, GNAT family  25.65 
 
 
195 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2883  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 
195 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3129  acetyltransferase  25.67 
 
 
195 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.203794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
206 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0859  hypothetical protein  30.16 
 
 
198 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.5826  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1744  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
201 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1614  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 
200 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755062  normal  0.374224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.24 
 
 
240 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0955169  normal  0.362531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1090  hypothetical protein  32.4 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.914734  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1258  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1811  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
201 aa  97.8  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1575  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1022  GCN5-related N-acetyltransferase  31.02 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2524  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2475  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1895  GCN5-related N-acetyltransferase  27.32 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.598769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
200 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1594  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
200 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
198 aa  94  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776348  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6315  GCN5-related N-acetyltransferase  25.54 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1220  hypothetical protein  27.66 
 
 
195 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2204  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351729  normal  0.46007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7783  acetyltransferase, GNAT family  31.49 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747821  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2919  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2941  acetyltransferase, GNAT family  34.64 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3264  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4468  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0622  hypothetical protein  31.02 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
236 aa  91.7  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0997  hypothetical protein  27.37 
 
 
202 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121835  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2491  GCN5-related N-acetyltransferase  29.47 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.927316  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3953  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0205  GNAT family acetyltransferase  31.32 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3059  GCN5-related N-acetyltransferase  29.26 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4157  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  33.06 
 
 
209 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0175949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3328  GCN5-related N-acetyltransferase  26.7 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365635  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2385  acetyltransferase, GNAT family  29.44 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2743  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
199 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1465  acetyltransferase  27.84 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3121  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.18307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4143  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0928  hypothetical protein  26.6 
 
 
202 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0129242  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1851  hypothetical protein  24.87 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2850  acetyltransferase  25.44 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112856  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2725  amino-acid acetyltransferase  27.92 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1121  acetyltransferase, GNAT family  36.29 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.411224  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  31.32 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0306  hypothetical protein  25.13 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0323  hypothetical protein  25.13 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0863  hypothetical protein  28.25 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106514  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21710  hypothetical protein  24.87 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9292  acetyltransferase, GNAT family  25.12 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2118  GCN5-related N-acetyltransferase  26.84 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.109403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.66399  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4742  acetyltransferase, GNAT family  24.73 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1092  putative amino-acid acetyltransferase  27.87 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.981692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1904  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6273  putative N-acetyltransferase (GCN5-related)  25.67 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00348  amino-acid acetyltransferase  33.33 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0276504  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>