30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2853 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  76.79 
 
 
119 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  75.22 
 
 
121 aa  180  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  86.81 
 
 
119 aa  174  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  86.81 
 
 
119 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  86.81 
 
 
119 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  86.81 
 
 
119 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  73.45 
 
 
121 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  86.81 
 
 
119 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  86.81 
 
 
122 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  86.81 
 
 
122 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  86.81 
 
 
124 aa  168  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  73.21 
 
 
118 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  72.97 
 
 
119 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  75.7 
 
 
122 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  47.62 
 
 
118 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  44.26 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  44.25 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  43 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  45.45 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  31.97 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  31.15 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  39.77 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  40.91 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  39.33 
 
 
121 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  35.06 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>