30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3017 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  243  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  77.69 
 
 		 125 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  77.69 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  50.94 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  41.73 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  45.61 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  48.96 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  48.39 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  48.39 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  44.25 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  47.17 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  43.59 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  43.59 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  49.46 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  48.39 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  49.04 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  48.86 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  48.96 
 
 		 118 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  44.34 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  46.53 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  37.62 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  37.62 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  45.56 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  45.56 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  45.56 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  31.9 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  36.61 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.130518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>