31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4175 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  79.34 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  52.99 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  51.28 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  38.74 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  43.1 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  38.74 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  36.67 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  41.57 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  41.57 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  41.57 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  41.57 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  42.05 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  39.77 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  39.77 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  39.77 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  38.94 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  44.94 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  45.83 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  40.52 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  45.56 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  35.56 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  35.56 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  39.77 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  33.93 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  34.62 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  37.96 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2761  hypothetical protein  39.02 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  42.19 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>