30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  233  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  89.83 
 
 
118 aa  196  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  58.93 
 
 
114 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  47.11 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  52.04 
 
 
119 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  52.58 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  54.55 
 
 
119 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  53.41 
 
 
119 aa  103  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  47.62 
 
 
122 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  53.41 
 
 
119 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  53.41 
 
 
119 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  53.41 
 
 
119 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  50.52 
 
 
122 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  52.27 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  52.27 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  52.27 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  49.48 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  52.94 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  53.61 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  50.94 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  51.61 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  52.22 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  44.68 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  42.39 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  34.75 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  35.4 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  34.88 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>