24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0642 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  41.77 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  32.17 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  34.75 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  32.58 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  32.58 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  32.58 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  37.31 
 
 		 119 aa  48.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  32.63 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  32.74 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  35.87 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0683  hypothetical protein  61.54 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0378275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  27.43 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  25.45 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  25.45 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  34 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  34 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>