29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0867 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  94.26 
 
 		 122 aa  234  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  58.72 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  49.48 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  48.45 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  43.43 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  39.02 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  41.94 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  42.55 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  41.94 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  41.94 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  42.55 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  42.55 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  31.15 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  40.86 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  39.5 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  42.71 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  40.86 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  33.9 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  37.23 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  37.78 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  30.43 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  35.56 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  35.56 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>