30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  229  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  58.93 
 
 
118 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  61.86 
 
 
122 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  56.25 
 
 
118 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  58.72 
 
 
122 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  51.43 
 
 
121 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  53.33 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  52.58 
 
 
121 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  47.9 
 
 
119 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  53.27 
 
 
118 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  52.69 
 
 
119 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  52.81 
 
 
119 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  54.55 
 
 
122 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  52.81 
 
 
119 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  52.81 
 
 
119 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  54.55 
 
 
122 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  54.55 
 
 
124 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  51.43 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  46.32 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  44 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  46.24 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  40.22 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  36.67 
 
 
116 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  27.43 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  36.78 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  32.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>