30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2347 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  96.64 
 
 		 121 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  96.64 
 
 		 119 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  97.48 
 
 		 119 aa  209  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  97.48 
 
 		 119 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  97.48 
 
 		 119 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  94.12 
 
 		 119 aa  200  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  83.19 
 
 		 119 aa  186  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  83.19 
 
 		 118 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  74.34 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  66.39 
 
 		 121 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  74.19 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  74.19 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  74.19 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  67.54 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  52.04 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  53 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  49.56 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  45.3 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  42.73 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  40.91 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  44.32 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  44.32 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  39.66 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  39.66 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  26.36 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  32.79 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>