29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2388 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  94.35 
 
 		 122 aa  205  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  95.16 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  78.23 
 
 		 121 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  71.9 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  65.81 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  65.81 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  82.76 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  75.27 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  74.19 
 
 		 119 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  74.19 
 
 		 119 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  74.19 
 
 		 119 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  73.12 
 
 		 119 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  67.52 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  68.38 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  47.79 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  51.89 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  43.33 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  45.13 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  42.72 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  48.86 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  48.86 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  42.16 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  42.05 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  42.05 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  37.9 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  32.26 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  37.9 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.130518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>