30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0508 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0508  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0954  hypothetical protein  92.47 
 
 
122 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.727611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2192  hypothetical protein  92.47 
 
 
122 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2388  hypothetical protein  92.47 
 
 
124 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0677  hypothetical protein  71.77 
 
 
121 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2853  hypothetical protein  75.7 
 
 
122 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1170  hypothetical protein  64.75 
 
 
119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1190  hypothetical protein  64.75 
 
 
121 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132402  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4173  hypothetical protein  75.27 
 
 
119 aa  156  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066997  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2347  hypothetical protein  74.19 
 
 
119 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000571758  unclonable  0.000000118502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1262  hypothetical protein  74.19 
 
 
119 aa  155  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1404  hypothetical protein  74.19 
 
 
119 aa  155  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0860523  normal  0.917275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3418  hypothetical protein  73.12 
 
 
119 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.269524  normal  0.0696032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1632  hypothetical protein  68.38 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0441  hypothetical protein  66.96 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59880  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00693126  hitchhiker  0.00000000000016867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36220  hypothetical protein  51.43 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3017  hypothetical protein  46.53 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4509  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3324  hypothetical protein  43.36 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2942  hypothetical protein  44.25 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1448  hypothetical protein  44.23 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0867  hypothetical protein  43.14 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3711  hypothetical protein  41.12 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0654  hypothetical protein  42.05 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0331  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.130518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4175  hypothetical protein  39.77 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4092  hypothetical protein  39.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0642  hypothetical protein  28.69 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3932  hypothetical protein  32.79 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>