24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0274 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  542  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  54.3 
 
 
271 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  54.84 
 
 
278 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  56.9 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  53.54 
 
 
259 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  55.43 
 
 
325 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  44.76 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  46.25 
 
 
296 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  46.09 
 
 
291 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  46.09 
 
 
291 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  46.09 
 
 
313 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  46.03 
 
 
251 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  47.04 
 
 
296 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  43.21 
 
 
312 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  43.32 
 
 
247 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  35.51 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  39.59 
 
 
247 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  37.66 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  38.43 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  38.14 
 
 
247 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  39.52 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  39.86 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  39.58 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>