24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3521 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  50.49 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  37.73 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  41.2 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  39.64 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  42.79 
 
 		 265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  39.04 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  38.16 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  40.72 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  38.54 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  37.7 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  39.9 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  34.68 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  35.97 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  35.97 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  35.97 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  37.33 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  35.08 
 
 		 296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  38.43 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  38.86 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  37.5 
 
 		 312 aa  99  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  45.3 
 
 		 190 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  36.95 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  42.4 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>