24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2301 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  47.81 
 
 
238 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  45.85 
 
 
251 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  46.64 
 
 
247 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  51.55 
 
 
265 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  41.49 
 
 
249 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  46.26 
 
 
269 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  44.66 
 
 
247 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  47.45 
 
 
254 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  40.26 
 
 
271 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  44.27 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  44.39 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  36.01 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  39.63 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  41.86 
 
 
313 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  41.86 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  41.86 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  37.37 
 
 
296 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  39.35 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  41.36 
 
 
240 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  50.46 
 
 
190 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  39.19 
 
 
312 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  39.9 
 
 
325 aa  85.5  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  41.94 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>