24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1041 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  57.2 
 
 		 278 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  57.38 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  56.41 
 
 		 271 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  54.2 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  49.17 
 
 		 291 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  49.17 
 
 		 291 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  49.17 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  46.67 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  50.23 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  47.9 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  56.9 
 
 		 325 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  49.17 
 
 		 296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  45.56 
 
 		 312 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  44.28 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  39.81 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  38.53 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  38.86 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  41.2 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  40.19 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  41.71 
 
 		 247 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  41.47 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  41.6 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  36.36 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>