24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7797 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  61.69 
 
 
271 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  54.84 
 
 
276 aa  240  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  57.2 
 
 
240 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  49.23 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  45.97 
 
 
265 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  54.3 
 
 
325 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  44.62 
 
 
291 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  44.62 
 
 
291 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  44.62 
 
 
313 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  45.1 
 
 
296 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  46.27 
 
 
296 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  43.04 
 
 
251 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  44.75 
 
 
312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  40.78 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  40.66 
 
 
269 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  40.53 
 
 
249 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  38.96 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  37.33 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  39.56 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  36.84 
 
 
254 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  44.39 
 
 
251 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  42.42 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  36.63 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>