24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12208 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  100 
 
 
312 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  64.16 
 
 
313 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  65.25 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  65.25 
 
 
291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  61.87 
 
 
296 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  62.14 
 
 
296 aa  295  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  44.96 
 
 
271 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  44.75 
 
 
278 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  50 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  43.21 
 
 
276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  47.97 
 
 
325 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  45.56 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  43.87 
 
 
265 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  35.51 
 
 
251 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  38.31 
 
 
249 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  39.76 
 
 
269 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  42.08 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  37.9 
 
 
247 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  39.52 
 
 
238 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  41.7 
 
 
247 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  34.68 
 
 
254 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  39.09 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  37.06 
 
 
190 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  36.78 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>