24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5625 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  47.13 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  45.97 
 
 
278 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  44.76 
 
 
276 aa  184  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  44.18 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  44.53 
 
 
247 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  44.35 
 
 
269 aa  178  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  42.19 
 
 
254 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  42.8 
 
 
240 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  41.03 
 
 
238 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  44.93 
 
 
259 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  43.37 
 
 
247 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  50.22 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  42.42 
 
 
249 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  40.93 
 
 
296 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  43.75 
 
 
291 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  43.75 
 
 
313 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  43.69 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  43.55 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  42.11 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  43.11 
 
 
312 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  45.59 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  41.96 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>