24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3275 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  99.66 
 
 
291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  98.97 
 
 
291 aa  577  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  82.13 
 
 
296 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  79.45 
 
 
296 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  64.16 
 
 
312 aa  316  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  44.62 
 
 
278 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  43.8 
 
 
271 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  45.27 
 
 
276 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  44.78 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  49.17 
 
 
240 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  49.63 
 
 
325 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  40.08 
 
 
269 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  39.58 
 
 
249 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  38.91 
 
 
247 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  35.55 
 
 
251 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  44.02 
 
 
265 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  37.16 
 
 
247 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  35.57 
 
 
238 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  37.22 
 
 
247 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  35.15 
 
 
254 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  37.33 
 
 
251 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  36.84 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  38.55 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>