24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4742 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4742  integral membrane protein  100 
 
 		 156 aa  299  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3521  integral membrane protein  42.4 
 
 		 238 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1279  hypothetical protein  42.42 
 
 		 271 aa  77  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0572  hypothetical protein  37.78 
 
 		 269 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3205  hypothetical protein  39.32 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2301  hypothetical protein  42.27 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5625  hypothetical protein  37.91 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00104167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1276  hypothetical protein  40.65 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0573  hypothetical protein  40.32 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7797  hypothetical protein  38.2 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0220  hypothetical protein  34.06 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625025  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1762  hypothetical protein  31.54 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  hitchhiker  0.00686542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4586  hypothetical protein  40.91 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0042  hypothetical protein  37.36 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4779  hypothetical protein  38.83 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0445568  normal  0.304219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3542  hypothetical protein  35.29 
 
 		 296 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12208  integral membrane protein  40 
 
 		 312 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1041  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3337  hypothetical protein  41.67 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3275  hypothetical protein  41.67 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3286  hypothetical protein  41.67 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.83229 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0274  hypothetical protein  39.58 
 
 		 276 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.458473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2969  hypothetical protein  40.51 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1629  hypothetical protein  37.08 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>