24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5007 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_5007  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  804    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.38 
 
 
389 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  58.91 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0724  TPR repeat-containing protein  58.59 
 
 
392 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0696  TPR repeat-containing protein  57.81 
 
 
392 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 
214 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.57 
 
 
524 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 
221 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.02 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  33.61 
 
 
958 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.57 
 
 
959 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.07 
 
 
1343 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.94 
 
 
192 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0719  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.2 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.27 
 
 
399 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.37 
 
 
180 aa  46.6  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.75 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.87 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.99 
 
 
176 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.33 
 
 
493 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.11 
 
 
1412 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.46 
 
 
501 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1573  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.56 
 
 
255 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 
208 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>