29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0494 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4521  transposase  66.21 
 
 
909 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  63.64 
 
 
513 aa  703    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
517 aa  1064    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  64.08 
 
 
515 aa  712    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  61.33 
 
 
511 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  64.08 
 
 
515 aa  712    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  60.67 
 
 
526 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  52.72 
 
 
529 aa  495  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  41.29 
 
 
512 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  32.78 
 
 
670 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  31.84 
 
 
688 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.15 
 
 
637 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  32.15 
 
 
635 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  31.67 
 
 
680 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  31.94 
 
 
725 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  31.53 
 
 
688 aa  229  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  29.21 
 
 
683 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  34.74 
 
 
380 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  30.47 
 
 
512 aa  194  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  29.33 
 
 
513 aa  193  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  29.58 
 
 
510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  29.08 
 
 
512 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  29.3 
 
 
512 aa  187  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  28.09 
 
 
509 aa  187  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  27.9 
 
 
514 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  28.25 
 
 
510 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  27.78 
 
 
513 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  27.78 
 
 
513 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0001  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  21.52 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>