29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2743 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1071    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  56.19 
 
 
512 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  63.76 
 
 
510 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1071    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  57.51 
 
 
510 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  57.82 
 
 
512 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  57.6 
 
 
513 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  57.09 
 
 
512 aa  622  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  54.35 
 
 
509 aa  608  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  56.04 
 
 
514 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  35.18 
 
 
635 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  34.98 
 
 
637 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  35.76 
 
 
688 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  37.06 
 
 
683 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  34.05 
 
 
670 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  37.28 
 
 
680 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  34.5 
 
 
688 aa  251  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  33.92 
 
 
725 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
517 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
515 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
515 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
511 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  26.89 
 
 
529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4521  transposase  26.25 
 
 
909 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
526 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  26.59 
 
 
513 aa  139  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  25.64 
 
 
512 aa  133  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  25.57 
 
 
380 aa  87  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0268  hypothetical protein  53.23 
 
 
67 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>