29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0474 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  71.09 
 
 
512 aa  781    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  71.48 
 
 
514 aa  768    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  66.4 
 
 
509 aa  721    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  70.7 
 
 
512 aa  751    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  65.69 
 
 
510 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  62.33 
 
 
510 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  72.55 
 
 
513 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  100 
 
 
512 aa  1060    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  57.82 
 
 
513 aa  629  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  57.82 
 
 
513 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  36.31 
 
 
688 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  36 
 
 
635 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  35.74 
 
 
637 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  35.43 
 
 
683 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  35.38 
 
 
680 aa  256  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  34.92 
 
 
670 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  33.94 
 
 
725 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  35.59 
 
 
688 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
517 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
515 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
515 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
526 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
511 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  27.56 
 
 
513 aa  153  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4521  transposase  26.67 
 
 
909 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  27.98 
 
 
529 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  25.67 
 
 
512 aa  133  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0268  hypothetical protein  74.6 
 
 
67 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  24.84 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>