29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2017 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  68.05 
 
 		 514 aa  725    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  65.87 
 
 		 509 aa  721    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  70.12 
 
 		 512 aa  750    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  72.55 
 
 		 512 aa  793    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  67.71 
 
 		 512 aa  725    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  63.65 
 
 		 510 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1066    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  62.28 
 
 		 510 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  57.6 
 
 		 513 aa  625  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  57.6 
 
 		 513 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  36.02 
 
 		 670 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  34.38 
 
 		 637 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  34.38 
 
 		 635 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  35.71 
 
 		 688 aa  267  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  35.91 
 
 		 688 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  36.72 
 
 		 680 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  35.09 
 
 		 725 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  35.83 
 
 		 683 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 517 aa  193  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 515 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 515 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  30.16 
 
 		 513 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4521  transposase  28.47 
 
 		 909 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  27.38 
 
 		 529 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  27.85 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0268  hypothetical protein  67.19 
 
 		 67 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  27.27 
 
 		 380 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>