28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3550 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  68.55 
 
 
688 aa  948    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  74.53 
 
 
637 aa  979    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  64.99 
 
 
688 aa  893    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  100 
 
 
670 aa  1381    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  74.21 
 
 
635 aa  975    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  66.07 
 
 
680 aa  907    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  65.86 
 
 
725 aa  942    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  35.87 
 
 
683 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  36.02 
 
 
513 aa  274  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  35.35 
 
 
512 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4521  transposase  33.62 
 
 
909 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  33.72 
 
 
510 aa  263  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  34.05 
 
 
513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  34.05 
 
 
513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
517 aa  259  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  34.68 
 
 
510 aa  256  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  33.33 
 
 
512 aa  256  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  34.62 
 
 
509 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  34.92 
 
 
512 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  34.21 
 
 
514 aa  247  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  31.57 
 
 
513 aa  234  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
515 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
515 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 
511 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  34.38 
 
 
529 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
526 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  29.13 
 
 
512 aa  200  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  28.29 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>