29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0482 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  56.19 
 
 
513 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  67.77 
 
 
514 aa  756    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  67.33 
 
 
509 aa  726    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  100 
 
 
512 aa  1066    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  63.67 
 
 
512 aa  692    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  64.31 
 
 
510 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  59.96 
 
 
510 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  56.19 
 
 
513 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  71.09 
 
 
512 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  70.12 
 
 
513 aa  750    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  37.04 
 
 
688 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  34.8 
 
 
637 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  34.8 
 
 
635 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  35.67 
 
 
688 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  36.84 
 
 
683 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  36.88 
 
 
680 aa  259  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  33.33 
 
 
670 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  34.65 
 
 
725 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
517 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
511 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4521  transposase  28.67 
 
 
909 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  30.5 
 
 
513 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  27.49 
 
 
529 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  25.11 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0268  hypothetical protein  74.6 
 
 
67 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  26.23 
 
 
380 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>