28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2895 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4521  transposase  61.51 
 
 
909 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  61.33 
 
 
517 aa  675    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  70.83 
 
 
515 aa  745    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
511 aa  1050    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  70.83 
 
 
515 aa  745    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  60.32 
 
 
513 aa  632  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  59.4 
 
 
526 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  51.81 
 
 
529 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  43.42 
 
 
512 aa  398  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  32.96 
 
 
670 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  31.52 
 
 
680 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  32.4 
 
 
725 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  31.26 
 
 
688 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  31.24 
 
 
637 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  31.24 
 
 
635 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  31.93 
 
 
688 aa  203  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  40.66 
 
 
380 aa  202  9e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  31.64 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  30.51 
 
 
513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  30.56 
 
 
683 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  31.49 
 
 
510 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  29.79 
 
 
512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  29.54 
 
 
509 aa  174  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  29.71 
 
 
512 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  28.97 
 
 
514 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  28.7 
 
 
510 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  27.97 
 
 
513 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  27.97 
 
 
513 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>