28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3296 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  100 
 
 
380 aa  786    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  44.41 
 
 
512 aa  232  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  40.45 
 
 
513 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4521  transposase  39.34 
 
 
909 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
526 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  37.5 
 
 
529 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  28.44 
 
 
725 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  29.35 
 
 
688 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  27.67 
 
 
688 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  26.23 
 
 
512 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  27.78 
 
 
509 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  25.57 
 
 
513 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  25.57 
 
 
513 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  28.29 
 
 
670 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  27.24 
 
 
680 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  27.3 
 
 
635 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.45 
 
 
637 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  26.42 
 
 
683 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  27.27 
 
 
513 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  28.01 
 
 
510 aa  92.8  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  26.64 
 
 
514 aa  91.3  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  25.77 
 
 
510 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  26.45 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  24.84 
 
 
512 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>