28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3214 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4804  hypothetical protein  74.51 
 
 
688 aa  1105    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1059  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  64.02 
 
 
637 aa  854    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1974  lycopene cyclase  63.55 
 
 
688 aa  921    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3550  hypothetical protein  65.86 
 
 
670 aa  942    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00222511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1030  hypothetical protein  64.02 
 
 
635 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1762  hypothetical protein  65.39 
 
 
680 aa  924    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3214  hypothetical protein  100 
 
 
725 aa  1495    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3909  hypothetical protein  39.02 
 
 
683 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2017  hypothetical protein  35.09 
 
 
513 aa  264  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0426  hypothetical protein  35.74 
 
 
512 aa  261  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1700  hypothetical protein  38.7 
 
 
514 aa  260  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0462  hypothetical protein  34.62 
 
 
510 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0482  hypothetical protein  34.65 
 
 
512 aa  253  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0474  hypothetical protein  33.94 
 
 
512 aa  253  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0265  hypothetical protein  37.19 
 
 
509 aa  243  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0272  hypothetical protein  34.55 
 
 
510 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0192  hypothetical protein  33.92 
 
 
513 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2743  hypothetical protein  33.92 
 
 
513 aa  238  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0494  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
517 aa  234  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4521  transposase  31.9 
 
 
909 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2267  hypothetical protein  32.4 
 
 
513 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0550  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 
515 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0567  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 
515 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2895  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
511 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0652  hypothetical protein  34.02 
 
 
529 aa  209  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1722  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
526 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00683163  hitchhiker  0.00144898 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28781  predicted protein  28.04 
 
 
512 aa  187  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3296  predicted protein  28.44 
 
 
380 aa  97.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>