16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1394 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1394  Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)- like protein  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0877714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6997  hypothetical protein  53.04 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1874  hypothetical protein  50 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.334307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  32.34 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1058  hypothetical protein  36.43 
 
 		 929 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0721278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  28.93 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  28.93 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  28.02 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  28.08 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  28.07 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  32.39 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  34.65 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6858  GrpE protein  30.64 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0571011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  24.82 
 
 		 209 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  30.38 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  27.59 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>