41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1874 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1874  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.334307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1394  Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)- like protein  47.48 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0877714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6997  hypothetical protein  35.15 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  34 
 
 
459 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1058  hypothetical protein  35.07 
 
 
929 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0721278  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  26.63 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  30.95 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  42.31 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl416  hsp70 cofactor  29.07 
 
 
187 aa  49.3  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  38.46 
 
 
212 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  26.63 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  23.66 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6858  GrpE protein  42.86 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0571011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  30.84 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  34.67 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  37.65 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  27.49 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  32.45 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  30.3 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  29.53 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.53 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  28.14 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  28.21 
 
 
183 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1772  GrpE protein  32.09 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0802801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  25.48 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  37.88 
 
 
298 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  30.81 
 
 
217 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  24.05 
 
 
187 aa  41.6  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>