More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3203 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3203  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  782    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3133  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.21 
 
 
379 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4368  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.9 
 
 
380 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.48 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.18 
 
 
381 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.12 
 
 
382 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.18 
 
 
380 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.86 
 
 
380 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.68 
 
 
387 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0858  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.14 
 
 
386 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  35.92 
 
 
381 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.66 
 
 
381 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.43 
 
 
385 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.82 
 
 
379 aa  225  8e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.99 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.960119  normal  0.0627799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  37.72 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.05 
 
 
383 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.08 
 
 
379 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.55 
 
 
382 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.87 
 
 
386 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  36.26 
 
 
382 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0092  butyryl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
378 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4023  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.82 
 
 
379 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.76 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  37.05 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.01 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.75 
 
 
380 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.57 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.31 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.36 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  37.66 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  35.16 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  35.16 
 
 
379 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1150  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.05 
 
 
380 aa  212  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.5 
 
 
396 aa  212  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7492  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.08 
 
 
380 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960511  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  34.11 
 
 
379 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.13 
 
 
389 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1835  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  34.72 
 
 
394 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.92 
 
 
377 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0503  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 
379 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  35.16 
 
 
379 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.64 
 
 
382 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.64 
 
 
380 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  36.01 
 
 
389 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.38 
 
 
386 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  35.16 
 
 
379 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.79 
 
 
383 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3916  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.99 
 
 
384 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.02 
 
 
379 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  34.9 
 
 
379 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.4 
 
 
389 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.99 
 
 
387 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.1 
 
 
383 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  36.34 
 
 
417 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  34.64 
 
 
379 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.64 
 
 
379 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.97 
 
 
377 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.59 
 
 
387 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  35.51 
 
 
386 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  34.64 
 
 
379 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  34.64 
 
 
379 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.05 
 
 
380 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
379 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.51 
 
 
381 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.4 
 
 
380 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.2 
 
 
394 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0556  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.75 
 
 
381 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000759492 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  34.64 
 
 
379 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.06 
 
 
383 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.65 
 
 
390 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.65 
 
 
390 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.46 
 
 
390 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.56 
 
 
379 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1710  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.85 
 
 
386 aa  205  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.9 
 
 
379 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  32.84 
 
 
381 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.16 
 
 
400 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
390 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.94 
 
 
391 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  35.75 
 
 
379 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.76 
 
 
384 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.84 
 
 
383 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.93 
 
 
386 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
379 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.28 
 
 
380 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1132  Acyl-CoA dehydrogenase, type 1  36.06 
 
 
385 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.16 
 
 
385 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  32.84 
 
 
376 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  32.84 
 
 
381 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.54 
 
 
388 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.54 
 
 
388 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>