51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1990 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 76 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  90.79 
 
 		 76 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  72.22 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  60.29 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  76 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  69.33 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  56.06 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  54.67 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  52 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  72.37 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  56.34 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  65.33 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  70.83 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  67.92 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  60 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  45.33 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  60.87 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  60 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  60 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  60 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  60.87 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  62.69 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  55.56 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  52.38 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  58.49 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  45.33 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  70.67 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  56 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  49.09 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  58.67 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  56 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  64.15 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  62.26 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  38.81 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2366  preprotein translocase, SecG subunit  63.89 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  55.56 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  58.06 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  40.35 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  64.15 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5196  preprotein translocase subunit SecG  64.15 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2706  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  42.47 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3707  preprotein translocase subunit SecG  56.6 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  39.13 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  36.51 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  35.94 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>