38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  100 
 
 		 99 aa  184  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  56.96 
 
 		 80 aa  92  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  53.95 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  53.25 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  55.7 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  48.1 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  66.67 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  53.97 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  56.52 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  50.63 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  59.32 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  49.37 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  39.24 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  56.41 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  60.27 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  56.86 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  53.7 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  57.14 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  59.49 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  59.49 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  58.06 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  55.36 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  48.72 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  54.41 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  54.41 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  35.21 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  54.41 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  36.84 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  53.52 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  50.68 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  38.46 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  58.49 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  50.75 
 
 		 86 aa  42  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  50.75 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>