53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1640 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 76 aa  140  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  75 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  76.32 
 
 		 76 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  85.53 
 
 		 76 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  60.29 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  68 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  68 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  68 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  68 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  73.58 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  61.84 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  53.33 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  72.37 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  64.79 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  65.22 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  67.57 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  43.94 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  47.89 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  64 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  45.33 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  56.6 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  76 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  61.33 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  58.82 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  55.77 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2366  preprotein translocase, SecG subunit  70.83 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  50.94 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  69.01 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  38.67 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  49.33 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  40.3 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5196  preprotein translocase subunit SecG  71.7 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2706  preprotein translocase subunit SecG  65.33 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3707  preprotein translocase subunit SecG  62.67 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  39.06 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  54.84 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  35.09 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  50.94 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  50.94 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  47.62 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  35.29 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  33.8 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>