43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2928 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
83 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  63.75 
 
 
80 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  63.75 
 
 
81 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  56.25 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  58.44 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  55.7 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  53.66 
 
 
83 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  65.38 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  58.82 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  62.5 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  48.75 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  61.73 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  68 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  61.84 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  54.17 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  61.43 
 
 
80 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  60 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  64 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  60 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  65 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  66.25 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  44.74 
 
 
77 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  51.28 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  54.17 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  52.11 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  54.17 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  52.11 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  57.14 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  37.93 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  31.58 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  52.11 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  36 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  64 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2366  preprotein translocase, SecG subunit  62 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  45.9 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4476  preprotein translocase, SecG subunit  41.89 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.648657  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  52 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  54.41 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5196  preprotein translocase subunit SecG  52.83 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>