96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3322 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 86 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  96.51 
 
 		 86 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  65.75 
 
 		 80 aa  98.2  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  57.53 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  56.52 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  63.89 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  59.38 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  68.52 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  51.35 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  71.21 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  59.65 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  56.52 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  67.16 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  64.15 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  54.79 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  56.34 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  56.34 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  56.34 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  61.64 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  59.7 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  47.22 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  66.67 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  62.86 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  60 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  56.25 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  45 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  51.79 
 
 		 81 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  63.64 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  70.37 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2366  preprotein translocase, SecG subunit  63.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  66.2 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  38.24 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  64.15 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  40.85 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  44.44 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  55.56 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5196  preprotein translocase subunit SecG  68 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0820  preprotein translocase, SecG subunit  44 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  35.59 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  30.77 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2706  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3707  preprotein translocase subunit SecG  58.49 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  40.3 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  42.62 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  37.97 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  36.67 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  37.31 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  40 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  44.44 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  42.62 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  36.67 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  35.48 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 111 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 111 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  56.36 
 
 		 99 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  40.98 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 111 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  38.33 
 
 		 111 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  32.47 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  27.4 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  30.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  33.33 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  31.94 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4476  preprotein translocase, SecG subunit  47.62 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.648657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  31.94 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  31.94 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 126 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  31.94 
 
 		 120 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>