40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0906 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 82 aa  152  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  80.25 
 
 		 82 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  66.25 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  67.9 
 
 		 81 aa  103  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  58.97 
 
 		 81 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  51.25 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  70 
 
 		 81 aa  87.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  56.58 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  62.5 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  70.51 
 
 		 83 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  46.91 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  54.17 
 
 		 80 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  49.28 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  60.78 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  54.29 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  48.68 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  49.3 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  61.25 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  43.42 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  56.6 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  52.83 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  60 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  49.3 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  54.93 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  56.52 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  47.89 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  47.37 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  50.7 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  36.07 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  56.6 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  50.7 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4476  preprotein translocase, SecG subunit  45 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.648657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  52.38 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  46.15 
 
 		 75 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>